Pessoalmente, prefiro o campeonato por pontos corridos, é mais justo. E para mim, é disso que o futebol brasileiro precisa: campeonato com menos times, pontos corridos e fim dessa bagunça toda.
Os que defendem um campeonato com fases extras, eliminatorias, usam o argumento de que as condições brasileiras são diferentes das européias, e isso é verdade. No campeonato europeu, muitas pessoas compram pacotes de ingressos para todo o campeonato. Então, mesmo quando as coisas ja estão definidas, os estadios não ficam muito vazios. No brasil, faltando, digamos, 10 rodadas de um returno, e com as coisas bem definidas, é capaz de o público nos estadios diminuir bastante.
Contra essa hipótese, podemos dizer que no Brasil o campeonato é muito mais competitivo que qualquer outro na Europa. Que ainda poderia continuar existindo um campeonato apenas eliminatorio, como a Copa do Brasil e, em alguns anos, as pessoas certamente se acostumariam a nova realidade (mais organizada, espero).
Ps. Se for para por uma final, esqueçam o campeonato por pontos corridos. É uma ilusão, ou é ou não é pontos corridos. Uma final torno o campeonato teoricamente tão eliminatório quanto com quartas de finais. Apenas o faz em um nível menor.