Vou postar uma teoria, acho que seria a que estava no link da Find mas que tá quebrado agora.
Here we go:
Peguei alguma coisa do Cinema em Cena e coisas que eu andei lendo.
Existem vários universos paralelos. Nós vivemos no universo 'real' por assim dizer. Raramente pode acontecer de uma anomalia do universo ocorrer e acabar por criar um 'efeito dominó' que pode levar ao fim do universo.
O que acontece é que quando a turbina cai na casa do Donnie Darko, ela é um artefato vindo do futuro. Isso causa um rompimento na barreira entre os universos, e a partir daquele momento, o universo real passa a se tornar o universo TANGENTE. Universos tangentes tem uma duração curta, que no filme, virá a durar 28 dias, 6 horas, 42 minutos e 12 segundos e depois acabar. O momento da virada seria quando o relógio marca meia-noite.
Quando esse universo terminar, ele irá consumir tudo ao seu redor, inclusive o universo real, dando fim à toda existência.
Existe uma teoria que fala sobre o rompimento de barreiras no espaço tempo no filme, chama-se 'A filosofia da viagem no tempo' escrito por Roberta Sparrow. No livro ela explica que pode acontecer de um artefato vir futuro - Teoria de Einstein - (que pode acontece em qualquer hora e qualquer lugar, segundo o filme), e criar um universo tangente paralelo.
Quem estiver perto do artefato quando ele cai, torna-se o Receptor, e é a função dele fazer com que o artefato volte ao seu local de origem, fechando o círculo. Ou seja, o Receptor deve fazer com que todo o ambiente seja
favorável para que o artefato viaje no tempo mais uma vez, fechando o 'wormhole' criado pela primeira vez, e assim salvar o universo (as partes do livro que explicam isso dá pra achar no site oficial).
Todas as pessoas ao redor do Receptor (o Donnie) passam a se tornar os Manipulados, pois eles serão manipulados por Donnie para que ele possa fazer o que for necessário. Além dos Manipulados Vivos (seus pais, amigos, professores ,etc...) há também os Manipulados Mortos, que são pessoas mortas no Universo Tangente que detêm o poder de voltar no tempo e ajudar Donnie em seu caminho.
O manipulado morto do filme é o coelho Frank. Ele tem a função de fazer com que Donnie faça tudo funcionar, para tal ele manda Donnie cometer atos que virão a ter uma consequência importante para o fluxo do universo!
O livro também explica que o Receptor passa a ter poderes sobre água e fogo, entretanto o Manipulado Morto terá mais poderes pois ele servirá de guia (isso eu achei um pouco de viagem).
No filme:
Frank salva a vida de Donnie pela primeira vez, para que ele possa fazer com que a turbina volte no tempo mais uma vez e feche o círculo.
Frank manda Donnie inundar o colégio para que ele possa conhecer Gretchen, que terá um importante papel, pois ela será a garantia de que Donnie faça seu trabalho, e também fará com que ele acredite que não irá morrer sozinho (seu maior medo).
Frank faz com que Donnie incendeie a casa do guru para assim eles encontrarem o calabouço pornô, e fazer com que a mãe de Donnie tome o avião de onde o artefato será extraído (outra garantia). Isso todo mundo deve ter pego.
Donnie, ainda confuso, mas certo do que vai fazer, vai atrás de Roberta Sparrow pra lhe dizer que ele é um Receptor. No momento em que ela é quase atropelada, ela está lendo a carta do Donnie. E depois que ele atira em Frank ela chega, na versão estendida, e diz pra ele algo como: "Corra que a tempestade está chegando".
Neste momento, quando Gretchen é atropelada e morta por Frank, Donnie percebe que este é um artíficio que faça com que ele cumpra sua missão, caso contrário sua mãe e seu amor serão mortos. Quando Frank faz com que Donnie encontre a arma no armário de seu pai, Donnie percebe depois que ele deve matar Frank, para que naquele ponto (quando ele morre) ele retorne ao passado e ajude Donnie a cumprir a missão., pois ele se torna um morto no Universo Tangente, com os poderes que eu disse acima.
Aí que está: Donnie prepara tudo, o 'wormhole' se abre, criando algum tipo de furacão ou fenômeno, que destroça o avião e suga a turbina para dentro dele (como um buraco negro). Da primeira vez que isso acontece, o buraco fica aberto pondo em risco o universo, então deve ocorrer de novo para se fechar. Ou seja, Donnie NÃO volta no passado, apenas a turbina faz a viagem no tempo.
No livro de Roberta Sparrow ela explica que uma vez que o círculo se fecha, todas as pessoas envolvidas têm a sensação de deja vú ou como se tivessem sonhado com tudo aquilo (por isso que tem aquela cena que todo mundo acorda). Quando acontece o fechamento do buraco, não há mais Frank para acordar Donnie e tirá-lo da casa, e por isso ele morre. Um sacrifício que ele deve fazer para salvar os que ama. Com isso ele evita que sua mãe morra no avião e que Gretchen e Frank morram, e também que o universo deixe de existir, claro.
A dúvida é se a irmã menor morreria de qualquer jeito... talvz ela não fosse na viagem pra Los Angeles se tivesse perdido o irmão.
O homem de laranja que aparece quando Donnie e Gretchen quase se beijam da primeira vez e depois aparece na festa de Halloween é apenas um funcionário da FAA que ficou na cidade para investigar os Darko por causa da queda da turbina.
E parece que na versão estendida haverá um porta retrato da irmã dele com o Frank que é o namorado dela.
O site oficial dá toda a explicação, e ainda dá um extra de coisas que acontecem.