Pessoalmente prefiro a Nintendo. Por que? Bem em grande maioria pelos seus próprios jogos e os das Second-partyes. Segue uma listinha:
Nintendo: Marios clássicos, não gostei do Mario 64, Super Smash Bros - Ambos, Mario Kart - os dois, Legend of Zelda todos - sem comentários, Pokémon - O RPG do Game Boy vicia totalmente, Pikmin - Nada mais legal que ter seu próprio exército de criaturas sem mente!, Metroid - termine em duas horas termine.
Rareware: Donkey Kong Country 1, 2 e 3 - Muito Bom!, Goldeneye - Inovou o estilo como o primeiro jogo de tiro com missões, Perfect Dark - Goldeneye aperfeiçoado principalmente no multiplayer, Banjo - O melhor jogo de plataforma em 3d, Conker's Bad Fur Day - Ria ria e ria é o jogo mais escrachado já lançado e tem um bom multiplayer.
Silicon Knights: Essa é nova, mas já criou o melhor jogo de horror até hoje: Eternal Darkness: Sanity's Requiem - Em três palavras: O HORROR, O HORROR, O HORROR! Muito, Mas Muito bom mesmo!
E é claro, a Nintendo sempre manteve o respeito pelos seus consumidores. Tenho um amigo meu dono de locadora que se derem um Playstation pra ele, ele joga na parede. Motivo? Ele comprou um Playstation 1 na primeira leva por 900 reais, DOIS repito DOIS meses depois o leitor pifou! Em suma ele perdeu todo o dinheiro!
Quanto a Microsoft tenho minhas dúvidas, mas pela minha experiência com o Ruimdows não confio nela...